Ученые из Комплексного онкологического центра VCU Massey (США) разработали алгоритм, позволяющий за считаные минуты определить типы клеток в организме и подобрать оптимальную противораковую терапию. Работа опубликована в журнале Nature Communications (NatCom).
Новая система получила название TACIT (Threshold-based Assignment of Cell Types from Multiplexed Imaging Data). Она анализирует экспрессию (активность) клеточных онко-маркеров и позволяет значительно ускорить их идентификацию — с нескольких недель до нескольких минут. Алгоритм использует массив данных, охватывающий более пяти миллионов клеток из таких систем организма, как головной мозг, кишечник и слюнные железы.
Авторы подчеркивают, что TACIT превосходит существующие методы без учителя как по точности, так и по масштабируемости. В отличие от прежних подходов, ограниченных узким набором маркеров, алгоритм способен различать даже схожие популяции клеток, а также выявлять новые клеточные состояния и ассоциации.
Алгоритм также показал высокую степень согласованности между разными типами биологических тестов — в частности, генетическими и белковыми. Это усиливает достоверность полученных данных и позволяет использовать TACIT в клинической практике. Разработка может помочь пациентам получать более точные диагнозы, избегать неэффективного лечения и быстрее находить подходящие клинические исследования. Для врачей это означает возможность оперативно оценивать происходящее в тканях и органах пациента на клеточном уровне.
Кроме того, по мнению исследователей, алгоритм может быть применен в фармакологии.
.webp?img-format=auto&img-1-resize=height:350,fit:max&img-2-filter=sharpen)
